VOX va presentar el 6 de setembre la querella contra tot el Govern i contra Forcadell, Guinó, Simó i Barrufet, però per diversos motius no s'ha admès a tràmit fins ara. El 15 de setembre VOX va ampliar la querella contra els membres de la Sindicatura Electoral de Catalunya. En l'escrit denunciaven l'anunci de referèndum, les partides pressupostàries de la Generalitat dedicades a la votació, la creació d'estructures d'estat, l'aprovació de la Llei de Transitorietat Jurídica, la compra d'urnes, la convocatòria de data i pregunta, la modificació del Reglament del Parlament, la signatura conjunta de la Llei del Referèndum i del decret de convocatòria i la "negativa oberta dels querellats a donar compliment a l'ordenament jurídic espanyol i a les resolucions del Tribunal Constitucional". 

 

Els delictes que denuncia VOX en la seva querella són els de prevaricació, usurpació d'atribucions i funcions, desobediència a l'autoritat judicial, conspiració per cometre rebel·lió, sedició en grau de temptativa, i malversació de fons públics, amb penes de fins a 20 anys de presó, inhabilitació per a càrrec públic durant el mateix període i multes econòmiques. El TSJC va remetre la querella a la fiscalia perquè es posicionés, i fa uns dies el ministeri públic es va mostrar favorable a la seva admissió a tràmit i l'acumulació en les dues causes ja obertes.