D'altra banda, la defensa de Junqueras nega el risc de fuga que apunta l'Audiència Nacional per mantenir-lo a presó al·legant que existeixen "indicis clars" del seu arrelament a Catalunya i destaca la seva actitud "col·laborativa" en presentar-se a la citació judicial del passat tres de novembre tot i el risc que fos enviat a presó, com finalment va acabar succeint. És per això que els advocats del vicepresident demanen ara mesures cautelars que no incloguin l'empresonament, apuntant també al fet que Junqueras és candidat a les eleccions del 21-D i que, per tant, estar privat de llibertat vulnera el seu dret a la participació política. 

També tornen a qüestionar els delictes de rebel·lió i sedició dels quals s'acusa Junqueras, pel fet que no hagi existit cap "alçament violent o tumultuari". Pel que fa al presumpte delicte de malversació de fons públics, recorden que, finalment, no es va gastar la partida del pressupost que suposadament hauria servit per finançar el referèndum de l'1 d'octubre. També han al·legat que s'ha vulnerat el dret a la defensa perquè l'Audiència Nacional no va donar el temps suficient per a preparar-la "amb garanties" i dubten de les competències de l'òrgan judicial per tractar els delictes que se l'imputen.